La preparación de ADN de referencia para estudios genotípicos

Autores/as

  • David Lovannisci University of California Santa Cruz, USA
  • Claire Gibson University of California Santa Cruz, USA, y Universidad Central del Ecuador, Quito, Ecuador
  • Hugo Espín Universidad Central del Ecuador
  • Edward Lammer Children’s Hospital Oakland Research Institute

Resumen

El objetivo de este laboratorio de investigación es comprender las interacciones que existen entre el medioambiente con el componente genético , y a su vez entender como estos podrían incrementar el riesgo de malformaciones congénitas. Como parte de ese esfuerzo , el laboratorio de investigaciones de defectos genéticos del C.H.O.R.I. (Birth Defects Research Laboratory Children's Hospital Oakland Research Institute ) ha estado llevando a cabo un estudio de caso-control que incorpora genotipificación de casos y controles en polimorfismos de posibles genes involucrados en el problema. Para llevar a cabo estos objetivos las nuevas técnicas de genotipificación desarrolladas son periódicamente evaluadas. Un panel de ADNs humanos se hace necesarios para servir como material de referencia, tanto para el desarrollo de nuevas formas de genotipificación como para servir como controles positivos para las variantes menos comunes de los polimorfismos en estudio. El objetivo en este reporte fue establecer una base de datos que servirá como referencia, utilizando sangre de donadores voluntarios. A estas personas se las genotipificó en los polimorfismos de los genes de nuestro interés. La sangre fue tomada de 29 donantes voluntarios. El ADN fue extraído bajo la técnica de precipitación con sales (salting out). Luego se realizó amplificación por técnica de PCR de los diferentes fragmentos que contenían los fragmentos de interés. A continuación el ADN fue digerido por enzimas de restricción para establecer los polimorfismos. Las bandas resultantes fueron separadas por electroforesis en gel. Los genotipos obtenidos fueron establecidos y luego introducidos en una base de datos computarizados para futuras referencias.

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Biografía del autor/a

David Lovannisci, University of California Santa Cruz, USA

Children’s Hospital Oakland Research Institute, USA

Claire Gibson, University of California Santa Cruz, USA, y Universidad Central del Ecuador, Quito, Ecuador

Children’s Hospital Oakland Research Institute, USA

Citas

1. lovannisci DM. Highly Efficient Recovery of DNA from Dried Blood Using the MasterPure™ Complete DNA and RNA Purification Kit. Epicentre Forum 2000;7(1):6-8.

2. Sachse C, et al. Cytochrome P450 2D6 variants in a Caucasian population: alíele frequencies and phenotypic consequences. Am J Hum Genet 1997;60(2):284-95.

3. Deitz AC, Dolí MA, Hein DW. A restriction fragment length polymorphism assay that differentiates human Nacetyltransferase-1 (NAT1) alíeles. Anal Biochem
1997;253(2):219-24.

4. Dolí MA, et al. Determination of human NAT2 acetylator genotype by restriction fragment-length polymorphism and allele-specific amplification. Anal Biochem
1995;231(2):413-20.

5. Arand M, et al. A multiplex polymerase chain reaction protocol for the simultaneous analysis of the glutathione S-transferase GSTM1 and GSTT1 polymorphisms. Anal Biochem 1996;236(1 ):184-6.

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Publicado

2017-06-09

Cómo citar

1.
Lovannisci D, Gibson C, Espín H, Lammer E. La preparación de ADN de referencia para estudios genotípicos. Rev Fac Cien Med (Quito) [Internet]. 9 de junio de 2017 [citado 8 de mayo de 2024];27(1):34-9. Disponible en: https://revistadigital.uce.edu.ec/index.php/CIENCIAS_MEDICAS/article/view/962